Formation Programmation R – Développer des packages

Toutes les bonnes pratiques pour créer, documenter, tester et partager des packages R !

18 sessions Eligible OPCO

Vue d'ensemble

Exploitez tout le potentiel de vos compétences en programmation R grâce à notre formation pour développeurs. Conçue pour les utilisateurs intermédiaires et avancés de R, cette formation complète vous guidera à travers le processus de création, de documentation, de test et de distribution des packages R. Pendant trois jours intensifs, vous maîtriserez les meilleures pratiques en matière de conception de fonctions, de contrôle de version, d'intégration continue et de soumission au CRAN. Donnez à votre équipe les moyens de contribuer à la communauté R et de rationaliser vos flux de travail grâce à des packages R robustes et bien documentés. Rejoignez-nous pour élever votre programmation R au niveau supérieur !

Public visé

Data analysts Data scientists Développeurs Utilisateurs

Prérequis

Bonnes connaissances en programmation R, familiarité avec RStudio.

Objectifs pédagogiques

Comprendre l’intérêt et la structure des packages R

Mettre en œuvre les meilleures pratiques pour écrire et documenter des fonctions

Développer des packages personnalisés

Utiliser les outils de debug appropriés et réaliser des tests unitaires

Distribuer des packages à son équipe ou au public

Versionner son code avec Git et s’approprier les principes de base de l’intégration continue

Programme détaillé

Introduction à la formation : comprendre les packages R

Qu’est-ce qu’un package R ?
Bénéfices attendus de l’utilisation des packages
Vue d’ensemble de la structure d’un package : fichier DESCRIPTION, fichier NAMESPACE, répertoires R/ et man/
Les packages ‘devtools’ et ‘usethis’
Création d’un premier package

Activités pratiques :

Exploration de la structure d’un package R existant, lecture d’un fichier DESCRIPTION, configuration d’un nou-veau package

Ecrire des fonctions pour des packages

Meilleures pratiques pour écrire des fonctions
Les notions fondamentales : factorisation, portée de variables, conventions…
Démonstration étape par étape de la création d’une fonction

Activités pratiques :

Écrire et documenter des fonctions simples.

Debugger et tester des fonctions

Les outils de debug dans R
Introduction aux tests unitaires
Ecrire et exécuter des tests, le workflow type
Organiser les tests

Activités pratiques :

Debugger une fonction en utilisant traceback() ou browser(), écrire des tests unitaires pour les fonctions avec ‘testthat’

Documentation

Créer une documentation complète avec roxygen2 : commentaires, blocs, tags, titres, descriptions…
Ecrire des vignettes de packages

Activités pratiques :

Documenter des fonctions et créer des vignettes.

Contrôle de version avec Git et intégration continue

Introduction à Git et GitHub
Configurer un répertoire
Meilleures pratiques pour le contrôle de version
Les principes de base de l’intégration continue
Mise en œuvre avec GitHub Actions

Activités pratiques :

Initialiser un répertoire git pour un package R, réaliser des commits et push sur GitHub.

Vérifications et distribution sur CRAN

Les commandes de vérification et de build avec devtools
Passer les checks du CRAN
Distribuer un package, les meilleures pratiques
Maintenance et mise à jour

Activités pratiques :

Exécution des checks CRAN avec devtools, préparer un package pour la soumission sur CRAN, publication d’un package R sur GitHub, gestion des mise à jour et du versionning.